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台盼蓝染色 台盼蓝是一种偶氮染料。活细胞有完整的膜结构，能够排斥台盼蓝，使之不能够进入胞内;而丧失活性或细胞膜不完整的细胞，膜的通透性增加，可被台盼蓝染成蓝色。
萘酚黄S染色 在植物种子中，无定形蛋白质常被一层膜包裹成圆球形颗粒，以糊粉粒的形式存在与植物细胞中。当种子萌发时这些蛋白质可以被利用。萘酚黄S可与蛋白质反应产生黄色。本染色主要用于植物种子的蛋白质染色。
蜡质叶片油红O染色 .样本放置于20倍样本体积的固定液中固定24h以上，常温运输送样。切勿固定时间过长，切勿冷冻结冰。冰冻切片-20℃运输。
NBT染色 活性氧（ROS）是指机体内或者自然环境中由氧组成，含氧并且性质活泼的物质的总称，主要是有一种激发态的氧分子（O2）。超氧阴离子自由基（O2¯）是其中的一种含氧自由基，将NBT还原成不溶于水的蓝色甲䐶，可定位O2¯的产生部位。染色应用：NBT与O2 ¯的组织化学反应主要用于检测新鲜植物组织中的活性氧（ROS），可直接在相机下观察拍照或
间本三酚木质素染色 间本三酚反应是植物纤维化学中确定木质化细胞壁的zui常用和zui简单的方法。这一反应的原理是当间本三酚在酸性环境下与细胞壁中的木质素相遇时，发生樱桃红色或紫红色反应。
碘-碘化钾染色能将淀粉染成蓝色，蛋白质染成黄色，常用于植物组织化学鉴定。和形态结构观察。
苯胺蓝染色 用于鉴别真菌，真菌的等电点较低，在液体环境中一般带负电荷，对于碱性染料有吸附作用，而苯胺蓝是一种碱性染料，可以和带负电荷的真菌结合，使真菌着色。
番红-固绿染色（植物） 植物番红固绿染色，石蜡切片技术里用观察植物组织的形态结构。韧皮部形成层芽尖根尖分生去等新生组织结构呈绿色，木质化木酸化的结构呈红色（软化后的木质化结构成分流失，结果呈绿色）。
植物硬组织切片甲苯胺蓝染色 硬组织切片针对未经化学试剂软化的硬组织，能很好地保留木质部结构和成分。甲苯胺蓝（Toluidine Blue O）是一种多色碱性染料，可使植物组织和细胞的不同成分染成不同的颜色。木质化部分呈蓝绿色，韧皮部呈蓝紫色，其他部分呈浅的蓝绿色。
植物硬组织切片番红固绿染色 硬组织切片针对未经化学试剂软化的硬组织，能很好地保留木质部结构和成分。番红固绿染色能显示植物木质部，其中韧皮部形成层等组织结构呈绿色，木质化木栓化的结构呈红色。
尼罗红染色（植物） 尼罗红是一种亲脂性的荧光染料，通过与脂类物质（腊酯、三酰甘油以及各种脂肪酸）结合后发出荧光检测信号，快速、敏感、可靠地检测出细胞内的脂类成分，在荧光显微镜（或共聚焦显微镜）下呈现桔红色或者红色。
抗酸染色 抗酸杆菌菌体胞壁内含有类脂质，并由糖脂形成一个蜡质的外壳，它与苯酚碱性品红结合形成复合物，这种复合物与菌体结合后能抵抗酸类的脱色，因而抗酸杆菌呈红色。苯酚作为媒染剂，提高染料的染色性能，使碱性品红与抗酸菌牢固结合，也有助于碱性品红的溶解。本法常用以检查结核杆菌和麻风杆菌。
