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普鲁士蓝染色 在酸性条件下，切片内的高铁盐与亚铁青化钾作用生成亚铁氰化铁。可用来观察组织细胞中有无铁元素存在，以及铁元素存在的位置及含量。
荧光桃红B染色 潘氏细胞是小肠腺的特征性细胞，位于腺底部，细胞呈锥形体，顶部胞质充满粗大嗜酸性的分泌颗粒。荧光桃红B本身作为一种酸性染料，相较于其它的酸性染料能够更清晰地显示潘氏细胞
AgNOR染色 细胞核核仁组织区即参与形成核仁的染色质区，其含有酸性非组蛋白类蛋白质，对银有较高的亲和力。也称嗜银蛋白。这些AgNOR参与核糖体基因RNA的转录，与核糖体的形成和蛋白质的合成密切相关。其数量和形状反应细胞的增殖活性，可用以鉴别正常细胞核肿瘤细胞。
grimeliusXSY染色 嗜银细胞是一类细胞，起源于神经外胚层，有强烈的嗜银性和（或）亲银性，用XSY液染色可见胞浆内出现棕黑色银反应颗粒，所以叫嗜银细胞，用Grimelius银染法显示小鼠十二指肠、回肠、盲肠嗜银细胞的生后发育情况，可用来研究小鼠肠道内分泌细胞的形态发生规律，为消化系统的生理和病理学研究提供形态学依据。正常时嗜银颗粒存在于神经内分泌细胞，此法也可用于神经内分泌肿瘤的检测
β-半乳糖苷酶染色 β-半乳糖甘酶染色，衰老细胞通常体积变会大，表达pH6.0时有高酶活性的β-半乳糖苷酶。染色中以X-ga1（5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷）为底物，在衰老特异性的β-半乳糖苷酶催化下，半乳糖苷键被水解生成深蓝色产物，光学显微镜下很容易观察到变成蓝色的表达β-半乳糖苷酶的细胞或组织。
肥大细胞染色 甲苯胺蓝能将组织内的肥大细胞清晰地显示出来，便于观察肥大细胞的数量分布变化情况及观察肥大细胞是否有脱颗粒现象。
胼胝质染色—苯胺蓝法 苯胺蓝染色，荧光显微镜观察。荧光易淬灭，切片不能长久保存，推荐整体扫描。
植物硬组织切片间本三酚染色 硬组织切片针对未经化学试剂软化的硬组织，能很好地保留木质部结构和成分。间本三酚反应是植物纤维化学中确定木质化细胞壁的zui常用和zui简单的方法。这一反应的原理是当间本三酚在酸性环境下与细胞壁中的木质素相遇时，发生樱桃红色或紫红色反应。
植物过氧化氢DAB染色 植物组织在胁迫条件下会产多种活性物质，过氧化氢是活性物质之一。过氧化氢（H₂O₂）在过氧化酶的催化下可与DAB迅速反应生成棕色化合物，从而定位植物组织中的H₂O₂。
未脱钙骨Van Gieson染色 Van Gieson染色，简称VG染色，常用于区分胶原纤维和肌纤维，染色原理与阴离子染料分子的大小和组织的渗透有关。未脱钙骨组织切片经VG染色后，胶原纤维呈红色或鲜红色，肌纤维及背景呈黄色。
未脱钙骨HE染色 苏木精-伊红染色法 （ hematoxylin-eosin staining ），简称HE染色法，石蜡切片技术里常用的染色法之一，也可以用于未脱钙骨硬组织切片。苏木精染液为碱性，主要使细胞核内的染色质与胞质内的核糖体着紫蓝色，伊红为酸性染料，主要使细胞质和细胞外基质中的成分着红色。HE染色法是组织学、胚胎学、病理学教学与科研中zui基本、使用zui广泛的技术方法。
植物刚果红染色 刚果红是一种酸性染料，能溶于水和乙醇，它可与具有三股螺旋链构象的多糖形成络合物，络合物的大吸收波长同刚果红相比发生红移，在一定范围内表现为大吸收波长的特征变化成紫红色。
