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阿利新蓝染色（AB染色），石蜡切片技术里用以区分羧基黏液还是硫酸化黏液物质，常用于黏液性上皮肿瘤的鉴别和证明肿瘤是否含有粘液物质;在骨组织中能有够清晰的标记出软骨。骨组织的软骨和肠组织的酸性粘液呈蓝色，细胞核呈红色。（若不复染核固红，则背景和细胞核均无色）
维多利亚蓝染色 维多利亚蓝是一种甲烷染料，可显示弹力纤维和乙型肝炎表面抗原，不易过染，染色后不易褪色 。用于观察组织内弹力纤维是否增生或断裂崩解，
Movat染色 技术能在一张组织切片显示动脉粥样硬化斑块5种颜色。广泛应用于心血管系统和胶原组织疾病研究。固绿（绿色） 分子量：806.86
弹力纤维间苯二酚碱性品红染色 间苯二酚碱性品红与铁形成一种很深的色淀复合物，其游离的氨基与弹性纤维内的氢键牢固结合呈紫蓝色。该颜色不易脱色，并能很好保存。
EVG染色 组织被含有三氯化铁和碘的苏木精染色再用过量的媒染剂三氯化铁中断组织与染料的结合，染料被分化液中的大量媒染剂吸引,使其从组织中清除。弹性纤维对铁苏木精具有较强的吸引力使染料能比其他组织保留更久而达到染色的效果。
VG染色 不同分子量大小的阴离子染料可以跟组织内渗透性大小不同的成分选择性地结合，从而把不同组织成分显示出来。组织和细胞成分都是多孔的结构，孔隙小组织结构致密，渗透性低;孔隙宽组织结构疏松，渗透性高。阴离子染料小分子量者易于穿透结构致密、渗透性低的成分，而大分子量者则只能进入结构疏松、渗透性高的成分。一般来说，结构致密、渗透性低的成分选择小分子染料，而结构疏松、渗透性高的成分选择大分子染料。
凯氏带染色 根的初生结构由外至内可分为表皮、皮层和维管柱3个部分。皮层内一层细胞为内皮层，细胞排列整齐而紧密，在细胞的上，横向壁和径向壁上，常有木质化和栓质化的加厚，呈带状环绕细胞一周，称凯氏带（casparian strip）。
瑞氏姬姆萨染色 用于生物染色剂，如原生质的染色，染色目的多为观察凋亡细胞和血细胞，骨髓细胞以及受虐原虫或幽门螺旋杆菌感染的胃肠肺肝脾等组织。实验中多用于区分白细胞，并计数分析。
β-半乳糖甘酶染色 染色中以X-ga1（5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷）为底物，在衰老特异性的β-半乳糖苷酶催化下，半乳糖苷键被水解生成深蓝色产物，光学显微镜下很容易观察到变成蓝色的表达β-半乳糖苷酶的细胞或组织。
油红O染色 油红O对脂滴的染色机制一般认为是物理学上的溶液作用或吸附作用，借溶液作用使脂质染色，即油红O先溶于60%异丙醇中，然后切片浸入油红O染液中时，油红O在组织脂质的溶解度较60%异丙醇中的溶解度高，所以在染色时油红O从60%异丙醇中转移入脂质中使脂滴显示红色
PAS-萘酚黄S染色 石蜡切片技术里用以观察植物组织中淀粉纤维素等糖类成分的分布，以及一些蛋白的分布和含量的检测。淀粉粒呈紫红色颗粒，细胞壁呈紫红色，蛋白质呈黄色
快速革兰氏染色 革兰氏染色法可用来观察细菌的形态并鉴别细菌;在选择药物方面有一定的参考价值;革兰氏阳性菌能产生外毒素，革兰氏阴性菌能产生内毒素，两者的致病作用不同，与致病性也有关。革兰氏阳性菌呈蓝色或蓝紫色，革兰氏阴性菌呈红色。
