植物硬组织切片甲苯胺蓝染色 硬组织切片针对未经化学试剂软化的硬组织，能很好地保留木质部结构和成分。甲苯胺蓝（Toluidine Blue O）是一种多色碱性染料，可使植物组织和细胞的不同成分染成不同的颜色。木质化部分呈蓝绿色，韧皮部呈蓝紫色，其他部分呈浅的蓝绿色。

植物硬组织切片番红固绿染色 硬组织切片针对未经化学试剂软化的硬组织，能很好地保留木质部结构和成分。番红固绿染色能显示植物木质部，其中韧皮部形成层等组织结构呈绿色，木质化木栓化的结构呈红色。

番红-固绿染色（软骨）在涉及关节软骨及软骨下骨的形态学研究中，常需联合使用多种染料以显示其组织学结构。其中，起源于上世纪60年代的番红O（safranin O）-固绿（fast green）染色因可以直观反映关节软骨、软骨下骨和骨组织的结构而备受青睐。软骨呈红色，成骨呈绿色。

LFB染色又称固蓝染色（FAST BLUE），一般染脑、脊髓、外周神经。神经髓鞘呈亮蓝色，背景无色至浅蓝色，主要用来显示神经髓鞘的形态结构及病理变化

尼氏染色 Franna Nissl （1860-1919） 1892年创立了Nissl染色法，以发现Nissl小体和Nissl变性而闻名它能够清楚地显示软骨形态潮线等结构，观察软骨组织是否有损伤。能将组织内的肥大细胞清晰地显示出来，便于观察肥大细胞的数量分布变化情况及观察肥大细胞是否有脱颗粒现象。

阿利新蓝染色（AB染色），石蜡切片技术里用以区分羧基黏液还是硫酸化黏液物质，常用于黏液性上皮肿瘤的鉴别和证明肿瘤是否含有粘液物质;在骨组织中能有够清晰的标记出软骨。骨组织的软骨和肠组织的酸性粘液呈蓝色，细胞核呈红色。（若不复染核固红，则背景和细胞核均无色）

EVG染色 组织被含有三氯化铁和碘的苏木精染色再用过量的媒染剂三氯化铁中断组织与染料的结合，染料被分化液中的大量媒染剂吸引,使其从组织中清除。弹性纤维对铁苏木精具有较强的吸引力使染料能比其他组织保留更久而达到染色的效果。

瑞氏姬姆萨染色 用于生物染色剂，如原生质的染色，染色目的多为观察凋亡细胞和血细胞，骨髓细胞以及受虐原虫或幽门螺旋杆菌感染的胃肠肺肝脾等组织。实验中多用于区分白细胞，并计数分析。